Preview

Юг России: экология, развитие

Расширенный поиск

НЕПОВИРУСЫ (PICORNAVIRALES, SECOVIRIDAE, NEPOVIRUS) НА ЮГЕ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА: РЕЗУЛЬТАТЫ МНОГОЛЕТНЕГО МОНИТОРИНГА

https://doi.org/10.18470/1992-1098-2017-4-105-119

Аннотация

Резюме. Цель настоящей работы заключается в анализе результатов многолетнего мониторинга представителей одного из наиболее важных и интересных фитовирусных таксонов – рода Nepovirus (Picornavirales, Secoviridae, Comovirinae) – который с 1962 г. на плановой основе осуществляется на юге Дальнего Востока (Приморский край, Хабаровский край, Сахалинская обл.) лабораторией вирусологии Федерального научного Центра биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук (Владивосток, Россия). Обсуждение. Многие (возможно, все) неповирусы способны вызывать эпифитотии со значительным экономическим ущербом для мировой экономики. В работе обсуждаются организация генома неповирусов, принципы деления их на три генетические группы (А, В и С), морфология вириона, принципы разделения на три плотностные фракции (T, M и B), характеристика фитопатологий, связанных с неповирусами, их экология на юге Дальнего Востока (включая источники изоляции и переносчиков), а также физико-химические свойства некоторых наиболее интересных штаммов из этого региона, которые повидимому могут представлять собой новые виды рода Nepovirus: вирус мозаики фримы азиатской (PhAMV – Phryma asiatica Mosaic Virus); вирус мозаики коммелины (DFMV – DayFlower Mosaic Virus); вирус некротической пятнистости пажитника (FoNSV – Foenugreek Necrotic Spot Virus); вирус некротической пятнистости овощного перца (CaNSV – Capsicum annuum Necrotic Spot Virus). Заключение. Неповирусы являются одними из наиболее приспособленных к циркуляции в фитоценозах умеренных широт, имеют природный резервуар в популяциях диких растений и представляют серьёзную угрозу для сельскохозяйственных культур. На основание экологических особенностей неповирусов приводится научно-обоснованный перечень профилактических и защитных мероприятий против эпифитотий неповирусной природы. Одним из важнейших элементов таких мероприятий является их плановый мониторинг на региональном уровне при обязательном сопоставлении получаемых результатов с общемировыми данными.

Об авторах

Надежда Н. Какарека
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.
Россия

 кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.



Зинаида Н. Козловская
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.
Россия

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.



Юрий Г. Волков
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.



Татьяна И. Плешакова
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.
Россия

научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.



Михаил В. Сапоцкий
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.
Россия

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.



Михаил Ю. Щелканов
Федеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН; Школа биомедицины, Дальневосточный федеральный университет; Национальный научный Центр морской биологии ДВО РАН.
Россия

доктор биологических наук, доцент, зав. лабораторией вирусологии Федерального научного Центра биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДО РАН; зав. лабораторией экологии микроорганизмов Дальневосточного федерального университета; ведущий научный сотрудник Национального научного Центра морской биологии ДО РАН.

 Владивосток.



Список литературы

1. Sanfacon H., Iwanami T., Karasev A.V., van der Vlugt R., Wellink J., Wetzel T., Yoshikawa N. Family Secoviridae. In: Virus Taxonomy. Ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Elsevier Science, 2011. P. 881–899.

2. Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Отряд Picornavirales. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 220– 225.

3. Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Сековирусы (Secoviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 249–255.

4. Щелканов М.Ю., Суняйкин А.Б., Коваленко Т.С., Львов Д.К. Современная таксономия пикорнавирусов (Picornavirales, Picornaviridae) // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2015. N3. С. 53–64.

5. Brown D.J., Halbrendt J.M., Robbins R.T., Vrain T.C. Transmission of Nepoviruses by Xiphinema americanum-group Nematodes // J. Nematol. 1993. V. 25. N3. P. 349–354.

6. Huff D.E., Davis R.F., Myers R.F. Longidorus breviannulatus as a vector for brome mosaic virus // J. Nematol. 1987. V. 19. N1. P. 143–146.

7. McElroy F.D., Brown D.J., Boag B. The virus-vector and damage potential, morphometrics and distribution of Paralongidorus maximus // J. Nematol. 1977. V. 9. N2. P. 122–130.

8. Schellenberger P., Andret-Link P., SchmittKeichinger C., Bergdoll M., Marmonier A., Vigne E., Lemaire O., Fuchs M., Demangeat G., Ritzenthaler C. A stretch of 11 amino acids in the betaB-betaC loop of the coat protein of grapevine fanleaf virus is essential for transmission by the nematode Xiphinema index // J. Virol. 2010. V. 84. N16. P. 7924–7933. DOI: 10.1128/JVI.00757-10

9. Schellenberger P., Sauter C., Lorber B., Bron P., Trapani S., Bergdoll M., Marmonier A., Schmitt Keichinger C., Lemaire O., Demangeat G., Ritzenthaler C. Structural insights into viral determinants of nematode mediated Grapevine fanleaf virus transmission // PLoS Pathog. 2011. V. 7. N5. P. e1002034. DOI: 10.1371/journal.ppat.1002034

10. Rebenstorf K., Candresse T., Dulucq M.J., Buttner C., Obermeier C. Host species-dependent population structure of a pollen-borne plant virus, Cherry leaf roll virus // J. Virol. 2006. V. 80. N5. P. 2453–2462.

11. Wang A., Sanfacon H. Proteolytic processing at a novel cleavage site in the N-terminal region of the tomato ringspot nepovirus RNA-1-encoded polyprotein in vitro // J. Gen. Virol. 2000. V. 81. N11. P. 2771–2781. DOI: 10.1099/0022-1317-81-11-2771

12. Pacot-Hiriart C., Latvala-Kilby S., Lehto K. Nucleotide sequence of black currant reversion associated nepovirus RNA1 // Virus Res. 2001. V. 79. N1-2. P. 145–152.

13. Thompson J.R., Leone G., Lindner J.L., Jelkmann W., Schoen C.D. Characterization and complete nucleotide sequence of Strawberry mottle virus: a tentative member of a new family of bipartite plant picorna-like viruses // J. Gen. Virol. 2002. V. 83. N1. P. 229–239. DOI: 10.1099/0022-1317-83-1-229

14. Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю. Сателлиты. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 350–352.

15. Trinh P.Q., Nguyen C.N., De La Pen E., Nguyen H.X., Moens M. Plant-parasitic nematodes associated with coffee in Vietnam // Russian Journal of Nematology. 2009. Т. 17. N1. С. 73–82.

16. Palomares-Rius J.E., Cantalapiedra-Navarrete C., Castillo P., Kikuchi T. Integrative diagnosis of the needle nematode Longidorus jonesi affecting forest in the Southern Japan // Forest Pathology. 2014. V. 44. N3. P. 246–249.

17. Zeng Y., Zhang Z., Sun H., Kerns J., Ye W., Yong L., Zhao K., Liang H., Huang Y. Morphological and molecular characterization of Xiphinema species from Shenzhen, China // Helminthologia. 2016. V. 53. N1. P. 62–75.

18. Волков Ю.Г., Какарека Н.Н. Влияние переносчиков на распространение вирусных заболеваний в агро- и биоценозах Дальнего Востока России // Материалы Всероссийской конференции с международным участием «Водные и экологические проблемы, преобразование экосистем в условиях глобального изменения климата: VI Дружининские чтения», Хабаровск, 28-30 сентября, 2016. С. 236–238.

19. Ladipo J.L., de Zoeten G.A. Influence of host and seasonal variation on the components of tobacco ring spot virus // Phytopathology. 1971. V. 62. P. 195–201.

20. Гордейчук О.Г. Вирус кольцевой пятнистости томатов на некоторых представителях родов Ribes и Rubus в Приморском крае. В сб.: Вирусологические исследования на Дальнем Востоке. Труды Биологопочвенного института. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1975. С. 17–29.

21. Gordejchuk O.G., Krylov A.V., Krylova N.V., Samonina I.N. Virus diseases of berry crops in the Soviet Far East. 1. Identification of the some mechanically transmitted viruses detected in Primorye territory // Zbl. Bakteriol. Parazitenk. Infectionskrankh. Hug. Abt.2. 1977. Bd. 132. N8. S. 686–707.

22. Макутенайте-Навалинскене М.К. Вирусные и микоплазменные болезни цветочных растений. Вильнюс: МОКСЛАС, 1981. 72 с.

23. Келдыш М.А., Помазков Ю.И. Вирусные и микоплазменные болезни древесных растений. Москва: Наука, 1985. 132 с.

24. Martin R.R., Tzanetakis I.E. Characterizations and recent advances in detection of strawberry viruses // Plant Diseases. 2006. V. 90. N4. P. 384–396.

25. Martin R.R., MacFarlane S., Sabanadzovic S., Quito D. Virus and virus diseases of Rubus // Plant Diseases. 2013. V. 97. N2. P. 168–182.

26. Костин В.Д. Вирозы дикорастущих растений Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2005. 121 с.

27. Какарека Н.Н., Волков Ю.Г. Неповирусы и их влияние на природные биосистемы // Материалы Всероссийской конференции с международным участием «Водные и экологические проблемы, преобразование экосистем в условиях глобального изменения климата: VI Дружининские чтения», Хабаровск, 28-30 сентября, 2016. С. 251–253.

28. Волков Ю.Г., Сапоцкий М.В., Щелканов М.Ю. Экономически значимые природноочаговые инфекции Приморского края // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 389–396.

29. Какарека Н.Н., Щелканов М.Ю. Профилактика распространения опасных фитовирусных инфекций на Дальнем Востоке // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 405–409.

30. Щелканов М.Ю., Волков Ю.Г., Какарека Н.Н., Козловская З.Н., Сапоцкий М.В., Толкач В.Ф., Плешакова Т.И., Гапека А.В., Галкина И.В. Организация Российской государственной коллекции вирусов Восточной Азии на базе ДВО РАН // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 466–470.

31. Поливанова Т.А. Возбудители вирусных болезней сои. В кн.: Возбудители болезней сельскохозяйственных растений Дальнего Востока. Москва: Наука, 1980. С. 51–68.

32. Волков Ю.Г., Какарека Н.Н., Дьяконов К.П. К вопросу о передаче тлями (Homoptera, Aphidinea) вируса кольцевой пятнистости табака // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2010. Вып. 2. С. 105–109.

33. Романова С.А., Леднева В.А., Плешакова Т.И., Какарека Н.Н., Волков Ю.Г., Козловская З.Н. Характеристика и таксономическая принадлежность вируса, выявленного на пажитнике в Приморском крае // Доклады РАСХН. 2005. N6. С. 19–23.


Рецензия

Для цитирования:


Какарека Н.Н., Козловская З.Н., Волков Ю.Г., Плешакова Т.И., Сапоцкий М.В., Щелканов М.Ю. НЕПОВИРУСЫ (PICORNAVIRALES, SECOVIRIDAE, NEPOVIRUS) НА ЮГЕ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА: РЕЗУЛЬТАТЫ МНОГОЛЕТНЕГО МОНИТОРИНГА. Юг России: экология, развитие. 2017;12(4):105-119. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2017-4-105-119

For citation:


Kakareka N.N., Kozlovskaya Z.N., Volkov Yu.G., Pleshakova T.I., Sapotsky M.V., Shchelkanov M.Yu. VIRUSES OF NEPOVIRUS GENUS (PICORNAVIRALES, SECOVIRIDAE) IN THE SOUTH OF THE FAR EAST: RESULTS OF LONGITUDINAL MONITORING. South of Russia: ecology, development. 2017;12(4):105-119. (In Russ.) https://doi.org/10.18470/1992-1098-2017-4-105-119

Просмотров: 780


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1992-1098 (Print)
ISSN 2413-0958 (Online)