ecodagЮг России: экология, развитиеSouth of Russia: ecology, development1992-10982413-0958State Institute of Applied Ecology of the Republic of Dagestan10.18470/1992-1098-2017-4-105-119ecodag-1018Research ArticleЭКОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВНЕПОВИРУСЫ (PICORNAVIRALES, SECOVIRIDAE, NEPOVIRUS) НА ЮГЕ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА: РЕЗУЛЬТАТЫ МНОГОЛЕТНЕГО МОНИТОРИНГАVIRUSES OF NEPOVIRUS GENUS (PICORNAVIRALES, SECOVIRIDAE) IN THE SOUTH OF THE FAR EAST: RESULTS OF LONGITUDINAL MONITORINGКакарекаНадежда Н.KakarekaNadezhda N.

 кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.

PhD in biology, Leader Researcher of the Laboratory of Virology.

 Vladivostok.

КозловскаяЗинаида Н.KozlovskayaZinaida N.

кандидат биологических наук, научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.

PhD in biology, Researcher of the Laboratory of Virology. 

 Vladivostok.

ВолковЮрий Г.VolkovYuryi G.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.

PhD in biology, Senior Researcher of the Laboratory of Virology.

 Vladivostok.

 

ПлешаковаТатьяна И.PleshakovaTatyana I.

научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.

Researcher of the Laboratory of Virology.

 Vladivostok.

СапоцкийМихаил В.SapotskyMikhail V.

кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории вирусологии.

 Владивосток.

PhD in biology, Senior Researcher of the Laboratory of Virology.

 Vladivostok.

ЩелкановМихаил Ю.ShchelkanovMikhail Yu.

доктор биологических наук, доцент, зав. лабораторией вирусологии Федерального научного Центра биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДО РАН; зав. лабораторией экологии микроорганизмов Дальневосточного федерального университета; ведущий научный сотрудник Национального научного Центра морской биологии ДО РАН.

 Владивосток.

PhD in biology, Doctor of Biological Sciences, Associate Professor, Chief of the Laboratory of Virology of Federal Scientific Center of the East Asia terrestrial biodiversity of Far Eastern Branch of Russian Academy of Sciences, Chief of the Laboratory of Microorganism Ecology of Far Eastern Federal University, Leader Researcher of National Scientific Center of Marine Biology of Far Eastern Branch of Russian Academy of Sciences.

 Vladivostok.

adorob@mail.ruФедеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН.РоссияFederal Scientific Center of the East Asia terrestrial biodiversity of Far Eastern Branch of Russian Academy of Sciences.Russian FederationФедеральный научный Центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии ДВО РАН; Школа биомедицины, Дальневосточный федеральный университет; Национальный научный Центр морской биологии ДВО РАН.Россия201730122017124105119Copyright © Какарека Н.Н., Козловская З.Н., Волков Ю.Г., Плешакова Т.И., Сапоцкий М.В., Щелканов М.Ю., 20172017Какарека Н.Н., Козловская З.Н., Волков Ю.Г., Плешакова Т.И., Сапоцкий М.В., Щелканов М.Ю.Kakareka N.N., Kozlovskaya Z.N., Volkov Y.G., Pleshakova T.I., Sapotsky M.V., Shchelkanov M.Y.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ecodag.elpub.ru/ugro/article/view/1018неповирусNepovirusSecoviridaePicornaviralesэпифитотияприродный резервуарпереносчикнематодаантисывороткаNepovirusSecoviridaePicornaviralesepiphytoticsnatural reservoirvectorNematodaantiseraReferencesSanfacon H., Iwanami T., Karasev A.V., van der Vlugt R., Wellink J., Wetzel T., Yoshikawa N. Family Secoviridae. In: Virus Taxonomy. Ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Elsevier Science, 2011. P. 881–899.Sanfacon H., Iwanami T., Karasev A.V., van der Vlugt R., Wellink J., Wetzel T., Yoshikawa N. Family Secoviridae. In: Virus Taxonomy. Ninth report of the international committee on taxonomy of viruses. Elsevier Science, 2011, pp. 881–899.Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Отряд Picornavirales. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 220– 225.Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu. Order Picornavirales. In: Rukovodstvo po virusologii. Virusy i virusnye infektsii cheloveka i zhivotnykh [Handbook of Virology. Viruses and Viral Infections of Humans and Animals]. Moscow, Meditsinskoe informatsionnoe agentstvo Publ., 2013, pp. 220–225. (In Russian)Львов Д.К., Щелканов М.Ю. Сековирусы (Secoviridae). В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 249–255.Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu. Secoviruses (Secoviridae). In: Rukovodstvo po virusologii. Virusy i virusnye infektsii cheloveka i zhivotnykh [Handbook of Virology. Viruses and Viral Infections of Humans and Animals]. Moscow, Meditsinskoe informatsionnoe agentstvo Publ., 2013, pp. 249–255. (In Russian)Щелканов М.Ю., Суняйкин А.Б., Коваленко Т.С., Львов Д.К. Современная таксономия пикорнавирусов (Picornavirales, Picornaviridae) // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2015. N3. С. 53–64.Shchelkanov M.Yu., Sunyaykin A.B., Kovalenko T.S., Lvov D.K. Modern Taxonomy of Picornaviruses (Picornavirales, Picornaviridae). Infektsionnye bolezni: novosti, mneniya, obuchenie [Infectious Diseases: News, Opinions, Education]. 2015, no. 3, pp. 53–64. (In Russian)Brown D.J., Halbrendt J.M., Robbins R.T., Vrain T.C. Transmission of Nepoviruses by Xiphinema americanum-group Nematodes // J. Nematol. 1993. V. 25. N3. P. 349–354.Brown D.J., Halbrendt J.M., Robbins R.T., Vrain T.C. Transmission of Nepoviruses by Xiphinema Americanum-group Nematodes. J. Nematol. 1993, vol. 25, no. 3, pp. 349–354.Huff D.E., Davis R.F., Myers R.F. Longidorus breviannulatus as a vector for brome mosaic virus // J. Nematol. 1987. V. 19. N1. P. 143–146.Huff D.E., Davis R.F., Myers R.F. Longidorus breviannulatus as a Vector for Brome Mosaic Virus. J. Nematol. 1987, vol. 19, no. 1, pp. 143–146.McElroy F.D., Brown D.J., Boag B. The virus-vector and damage potential, morphometrics and distribution of Paralongidorus maximus // J. Nematol. 1977. V. 9. N2. P. 122–130.McElroy F.D., Brown D.J., Boag B. The Virus-Vector and Damage Potential, Morphometrics and Distribution of Paralongidorus maximus. J. Nematol. 1977, vol. 9, no. 2, pp. 122–130.Schellenberger P., Andret-Link P., SchmittKeichinger C., Bergdoll M., Marmonier A., Vigne E., Lemaire O., Fuchs M., Demangeat G., Ritzenthaler C. A stretch of 11 amino acids in the betaB-betaC loop of the coat protein of grapevine fanleaf virus is essential for transmission by the nematode Xiphinema index // J. Virol. 2010. V. 84. N16. P. 7924–7933. DOI: 10.1128/JVI.00757-10Schellenberger P., Andret-Link P., SchmittKeichinger C., Bergdoll M., Marmonier A., Vigne E., Lemaire O., Fuchs M., Demangeat G., Ritzenthaler C. A Stretch of 11 Amino Acids in the BetaB-BetaC Loop of the Coat Protein of Grapevine Fanleaf Virus is essential for Transmission by the Nematode Xiphinema Index. J. Virol. 2010, vol. 84, no. 16, pp. 7924–7933. DOI: 10.1128/JVI.00757-10Schellenberger P., Sauter C., Lorber B., Bron P., Trapani S., Bergdoll M., Marmonier A., Schmitt Keichinger C., Lemaire O., Demangeat G., Ritzenthaler C. Structural insights into viral determinants of nematode mediated Grapevine fanleaf virus transmission // PLoS Pathog. 2011. V. 7. N5. P. e1002034. DOI: 10.1371/journal.ppat.1002034Schellenberger P., Sauter C., Lorber B., Bron P., Trapani S., Bergdoll M., Marmonier A., SchmittKeichinger C., Lemaire O., Demangeat G., Ritzenthaler C. Structural insights into viral determinants of nematode mediated Grapevine fanleaf virus transmission. PLoS Pathog. 2011, vol. 7, no. 5, pp. e1002034. DOI: 10.1371/journal.ppat.1002034Rebenstorf K., Candresse T., Dulucq M.J., Buttner C., Obermeier C. Host species-dependent population structure of a pollen-borne plant virus, Cherry leaf roll virus // J. Virol. 2006. V. 80. N5. P. 2453–2462.Rebenstorf K., Candresse T., Dulucq M.J., Buttner C., Obermeier C. Host Species-dependent Population Structure of a Pollen-borne Plant Virus, Cherry Leaf Roll Virus. J. Virol. 2006, vol. 80, no. 5, pp. 2453–2462.Wang A., Sanfacon H. Proteolytic processing at a novel cleavage site in the N-terminal region of the tomato ringspot nepovirus RNA-1-encoded polyprotein in vitro // J. Gen. Virol. 2000. V. 81. N11. P. 2771–2781. DOI: 10.1099/0022-1317-81-11-2771Wang A., Sanfacon H. Proteolytic Processing at a Novel Cleavage Site in the N-terminal Region of the Tomato Ringspot Nepovirus RNA-1-encoded Polyprotein in vitro. J. Gen. Virol. 2000, vol. 81, no. 11, pp. 2771–2781. DOI: 10.1099/0022-1317-81-11-2771Pacot-Hiriart C., Latvala-Kilby S., Lehto K. Nucleotide sequence of black currant reversion associated nepovirus RNA1 // Virus Res. 2001. V. 79. N1-2. P. 145–152.Pacot-Hiriart C., Latvala-Kilby S., Lehto K. Nucleotide Sequence of Black Currant Reversion Associated Nepovirus RNA1. Virus Res. 2001, vol. 79, no. 1-2, pp. 145–152.Thompson J.R., Leone G., Lindner J.L., Jelkmann W., Schoen C.D. Characterization and complete nucleotide sequence of Strawberry mottle virus: a tentative member of a new family of bipartite plant picorna-like viruses // J. Gen. Virol. 2002. V. 83. N1. P. 229–239. DOI: 10.1099/0022-1317-83-1-229Thompson J.R., Leone G., Lindner J.L., Jelkmann W., Schoen C.D. Characterization and Complete Nucleotide Sequence of Strawberry Mottle Virus: a Tentative Member of a New Family of Bipartite Plant Picorna-like Viruses. J. Gen. Virol. 2002, vol. 83, no. 1, pp. 229–239. DOI: 10.1099/0022-1317-83-1-229Львов Д.К., Альховский С.В., Щелканов М.Ю. Сателлиты. В кн.: Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных. Москва: Медицинское информационное агентство, 2013. С. 350–352.Lvov D.K., Alkhovsky S.V., Shchelkanov M.Yu. Satellites. In: Rukovodstvo po virusologii. Virusy i virusnye infektsii cheloveka i zhivotnykh [Handbook of Virology. Viruses and Viral Infections of Humans and Animals]. Moscow, Meditsinskoe informatsionnoe agentstvo Publ., 2013, pp. 350–352. (In Russian)Trinh P.Q., Nguyen C.N., De La Pen E., Nguyen H.X., Moens M. Plant-parasitic nematodes associated with coffee in Vietnam // Russian Journal of Nematology. 2009. Т. 17. N1. С. 73–82.Trinh P.Q., Nguyen C.N., De La Pen E., Nguyen H.X., Moens M. Plant-Parasitic Nematodes Associated with Coffee in Vietnam. Russian Journal of Nematology. 2009, vol. 17, no. 1, pp. 73–82.Palomares-Rius J.E., Cantalapiedra-Navarrete C., Castillo P., Kikuchi T. Integrative diagnosis of the needle nematode Longidorus jonesi affecting forest in the Southern Japan // Forest Pathology. 2014. V. 44. N3. P. 246–249.Palomares-Rius J.E., Cantalapiedra-Navarrete C., Castillo P., Kikuchi T. Integrative Diagnosis of the Needle Nematode Longidorus jonesi Affecting Forest in the Southern Japan. Forest Pathology. 2014, vol. 44, no. 3, pp. 246–249.Zeng Y., Zhang Z., Sun H., Kerns J., Ye W., Yong L., Zhao K., Liang H., Huang Y. Morphological and molecular characterization of Xiphinema species from Shenzhen, China // Helminthologia. 2016. V. 53. N1. P. 62–75.Zeng Y., Zhang Z., Sun H., Kerns J., Ye W., Yong L., Zhao K., Liang H., Huang Y. Morphological and Molecular Characterization of Xiphinema Species from Shenzhen, China. Helminthologia. 2016, vol. 53, no. 1, pp. 62–75.Волков Ю.Г., Какарека Н.Н. Влияние переносчиков на распространение вирусных заболеваний в агро- и биоценозах Дальнего Востока России // Материалы Всероссийской конференции с международным участием «Водные и экологические проблемы, преобразование экосистем в условиях глобального изменения климата: VI Дружининские чтения», Хабаровск, 28-30 сентября, 2016. С. 236–238.Volkov Yu.G., Kakareka N.N. Vliyanie perenoschikov na rasprostranenie virusnykh zabolevanii v agro- i biotsenozakh Dal'nego Vostoka Rossii [Influence of vectors to spreading of virus diseases in agro- and biocenoses of Russian Far East]. Materialy Vserossiiskoi konferentsii s mezhdunarodnym uchastiem «Vodnye i ekologicheskie problemy, preobrazovanie ekosistem v usloviyakh global'nogo izmeneniya klimata: VI Druzhininskie chteniya», Khabarovsk, 28-30 sentyabrya, 2016 [Proceedings of All-Russian Conference with International Participation “Water and Ecological Problems, Ecosystems Transformations under the Global Climate Change: VI Druzhinin’s Readings”, Khabarovsk, 28-30 September 2016]. Khabarovsk, 2016, pp. 236– 238. (In Russian)Ladipo J.L., de Zoeten G.A. Influence of host and seasonal variation on the components of tobacco ring spot virus // Phytopathology. 1971. V. 62. P. 195–201.Ladipo J.L., de Zoeten G.A. Influence of Host and Seasonal Variation on the Components of Tobacco Ring Spot Virus. Phytopathology. 1971, Vol. 62, pp. 195–201.Гордейчук О.Г. Вирус кольцевой пятнистости томатов на некоторых представителях родов Ribes и Rubus в Приморском крае. В сб.: Вирусологические исследования на Дальнем Востоке. Труды Биологопочвенного института. Владивосток: ДВНЦ АН СССР, 1975. С. 17–29.Gordejchuk O.G. Tomato Ringspot Virus on Some Members of Ribes and Rubus in Primorsky Krai. In: Virusologicheskie issledovaniya na Dal'nem Vostoke. Trudy Biologo-pochvennogo instituta [Virological investigations in the Far East. Proceedings of the Institute of Biology and Soil Science]. Vladivostok, Far Eastern Scientific Center of USSR Academy of Sciences Publ., 1975, pp. 17–29. (In Russian)Gordejchuk O.G., Krylov A.V., Krylova N.V., Samonina I.N. Virus diseases of berry crops in the Soviet Far East. 1. Identification of the some mechanically transmitted viruses detected in Primorye territory // Zbl. Bakteriol. Parazitenk. Infectionskrankh. Hug. Abt.2. 1977. Bd. 132. N8. S. 686–707.Gordejchuk O.G., Krylov A.V., Krylova N.V., Samonina I.N. Virus Diseases of Berry Crops in the Soviet Far East. 1. Identification of the Some Mechanically Transmitted Viruses Detected in Primorye Territory. Zbl. Bakteriol. Parazitenk. Infectionskrankh. Hug. Abt.2. 1977, bd. 132, no. 8, ss. 686–707.Макутенайте-Навалинскене М.К. Вирусные и микоплазменные болезни цветочных растений. Вильнюс: МОКСЛАС, 1981. 72 с.Makutenaite-Navalinskene M.K. Virusnye i mikoplazmennye bolezni tsvetochnykh rastenii [Virus and Mycoplasma Diseases of Flowering Plants]. Vilnius, MOKSLAS Publ., 1981, 22 p. (In Russian)Келдыш М.А., Помазков Ю.И. Вирусные и микоплазменные болезни древесных растений. Москва: Наука, 1985. 132 с.Keldysh M.A., Pomazkov Yu.I. Virusnye i mikoplazmennye bolezni drevesnykh rastenii [Virus and Mycoplasma Diseases of Tree Plants]. Moscow, Nauka Publ., 1985, 132 p. (In Russian)Martin R.R., Tzanetakis I.E. Characterizations and recent advances in detection of strawberry viruses // Plant Diseases. 2006. V. 90. N4. P. 384–396.Martin R.R., Tzanetakis I.E. Characterizations and Recent Advances in Detection of Strawberry Viruses. Plant Diseases. 2006, vol. 90, no. 4, pp. 384–396.Martin R.R., MacFarlane S., Sabanadzovic S., Quito D. Virus and virus diseases of Rubus // Plant Diseases. 2013. V. 97. N2. P. 168–182.Martin R.R., MacFarlane S., Sabanadzovic S., Quito D. Virus and Virus Diseases of Rubus. Plant Diseases. 2013, vol. 97, no.2, pp. 168–182.Костин В.Д. Вирозы дикорастущих растений Дальнего Востока России. Владивосток: Дальнаука, 2005. 121 с.Kostin V.D. Virozy dikorastushchikh rastenii Dal'nego Vostoka Rossii [Viroses of Wild Plants of the Russian Far East]. Vladivostok, Dal'nauka Publ., 2005, 121 p. (In Russian)Какарека Н.Н., Волков Ю.Г. Неповирусы и их влияние на природные биосистемы // Материалы Всероссийской конференции с международным участием «Водные и экологические проблемы, преобразование экосистем в условиях глобального изменения климата: VI Дружининские чтения», Хабаровск, 28-30 сентября, 2016. С. 251–253.Kakareka N.N., Volkov Yu.G. Nepovirusy i ikh vliyanie na prirodnye biosistemy [Nepoviruses and Their Influence on Natural Biosystems]. Materialy Vserossiiskoi konferentsii s mezhdunarodnym uchastiem «Vodnye i ekologicheskie problemy, preobrazovanie ekosistem v usloviyakh global'nogo izmeneniya klimata: VI Druzhininskie chteniya», Khabarovsk, 28-30 sentyabrya, 2016 [Proceedings of All-Russian Conference with International Participation “Water and Ecological Problems, Ecosystems Transformations under the Global Climate Change: VI Druzhinin’s Readings”, Khabarovsk, 28-30 September 2016]. Khabarovsk, 2016, pp. 251– 253. (In Russian)Волков Ю.Г., Сапоцкий М.В., Щелканов М.Ю. Экономически значимые природноочаговые инфекции Приморского края // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 389–396.Volkov Yu.G., Sapotsky M.V., Shchelkanov M.Yu. Ekonomicheski znachimye prirodnoochagovye infektsii Primorskogo kraya [Economically Significant Natural Foci Iinfections of Primorsky Krai]. Nauchnye trudy mezhdunarodnykh nauchnykh chtenii «Primorskie Zori 2017», Vladivostok, 20-22 aprelya, 2017 [Proceedings of International readings “Maritime Sunrises 2017”, Vladivostok, 20-22 April 2017]. Vladivostok, FEFU Publ., 2017, pp. 389–396. (In Russian)Какарека Н.Н., Щелканов М.Ю. Профилактика распространения опасных фитовирусных инфекций на Дальнем Востоке // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 405–409.Kakareka N.N., Shchelkanov M.Yu. Profilaktika rasprostraneniya opasnykh fitovirusnykh infektsii na Dal'nem Vostoke [Prophylaxis of distribution of dangerous phytovirus infections in the Far East]. Nauchnye trudy mezhdunarodnykh nauchnykh chtenii «Primorskie Zori 2017», Vladivostok, 20-22 aprelya, 2017 [Proceedings of International readings “Maritime Sunrises 2017”, Vladivostok, 20-22 April 2017]. Vladivostok, FEFU Publ., 2017, pp. 405–409. (In Russian)Щелканов М.Ю., Волков Ю.Г., Какарека Н.Н., Козловская З.Н., Сапоцкий М.В., Толкач В.Ф., Плешакова Т.И., Гапека А.В., Галкина И.В. Организация Российской государственной коллекции вирусов Восточной Азии на базе ДВО РАН // Научные труды международных научных чтений «Приморские Зори 2017», Владивосток, 20-22 апреля, 2017. С. 466–470.Shchelkanov M.Yu., Volkov Yu.G., Kakareka N.N., Kozlovskaya Z.N., Sapotsky M.V., Tolkach V.F., Pleshakova T.I., Gapeka A.V., Galkina I.V. Organizatsiya Rossiiskoi gosudarstvennoi kollektsii virusov Vostochnoi Azii na baze DVO RAN [Organization of Russian State Collection of Viruses from Eastern Asia on the base of Far Eastern Branch of Russian Academy of Sciences]. Nauchnye trudy mezhdunarodnykh nauchnykh chtenii «Primorskie Zori 2017», Vladivostok, 20-22 aprelya, 2017 [Proceedings of International readings “Maritime Sunrises 2017”, Vladivostok, 20-22 April 2017]. Vladivostok, FEFU Publ., 2017, pp. 466–470. (In Russian)Поливанова Т.А. Возбудители вирусных болезней сои. В кн.: Возбудители болезней сельскохозяйственных растений Дальнего Востока. Москва: Наука, 1980. С. 51–68.Polivanova T.A. Vozbuditeli virusnykh boleznei soi. In: Vozbuditeli boleznei sel'skokhozyaistvennykh rastenii Dal'nego Vostoka [Etiological Agents of Virus Diseases of Soy]. Moscow, Nauka Publ., 1980. pp. 51–68. (In Russian)Волков Ю.Г., Какарека Н.Н., Дьяконов К.П. К вопросу о передаче тлями (Homoptera, Aphidinea) вируса кольцевой пятнистости табака // Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2010. Вып. 2. С. 105–109.Volkov Y.G., Kakareka N.N., Dyakonov K.P. On the Issue of Transfer of Aphids (Homoptera Aphidinea) Tobacco Ringspot Virus. Izvestiya Timiryazevskoi sel'skokhozyaistvennoi akademii [Proceedings of the Timiryazev Agriculture Academy]. 2010, iss. 2, pp. 105– 109. (In Russian)Романова С.А., Леднева В.А., Плешакова Т.И., Какарека Н.Н., Волков Ю.Г., Козловская З.Н. Характеристика и таксономическая принадлежность вируса, выявленного на пажитнике в Приморском крае // Доклады РАСХН. 2005. N6. С. 19–23.Romanova S.A., Ledneva V.A., Pleshakova N.I., Kakareka N.N., Volkov Yu.G., Kozlovskaya Z.N. Characteristics and taxonomic status of virus isolated from foenugreek. Doklady Rossiiskoi akademii sel'skokhozyaistvennykh nauk [Proceedings of Russian Academy of Agricultural Sciences]. 2005, no. 6, pp. 19–23. (In Russian)

The authors declare that there are no conflicts of interest present.