Вирусные трансмиссивные патогены в клещах из природных биотопов Европейской части России
https://doi.org/10.18470/1992-1098-2025-3-2
Аннотация
Целью работы являлось выявление в твердых клещах, собранных в нескольких регионах Европейской части России, вирусов, передающихся трансмиссивно.
Вирусную РНК клещей рода Ixodes, собранных из природных очагов клещевого энцефалита Астраханской области, Карелии и Ставропольского края, исследовали методом ПЦР и секвенированием полученных вирусоспецифических ДНК фрагментов.
В клещах, собранных в Астраханской области, Карелии и Ставропольском крае обнаружены геномные маркеры вирусов семейств Flaviviridae, Phenuiviridae и Nairoviridae.
В клещах Ixodes, собранных в Астраханской области, Карелии и Ставропольском крае, были обнаружены генетические маркеры вирусов, ранее не описанных для России. Природные очаги клещевых инфекций проявляют тенденцию к расширению ареала, в связи с чем, большую актуальность приобретают исследования по выявлению новых вирусов, экологически связанных с иксодовыми клещами.
Ключевые слова
Об авторах
В. А. ТерновойРоссия
Владимир А. Терновой, к.б.н., и.о. заведующего отделом молекулярной вирусологии и вирусных гепатитов, ведущий научный сотрудник
630559 Новосибирская область, г. Новосибирск, р/п Кольцово.
Тел. +79137355577
Е. П. Пономарева
Россия
Евгения П. Пономарева
Кольцово, Новосибирская область
Н. Л. Тупота
Россия
Наталья Л. Тупота
Кольцово, Новосибирская область
М. А. Степанюк
Россия
Марина А. Степанюк
Кольцово, Новосибирская область
М. Ю. Карташов
Россия
Михаил Ю. Карташов
Кольцово, Новосибирская область
Р. Б. Баяндин
Россия
Роман Б. Баяндин
Кольцово, Новосибирская область
Т. В. Трегубчак
Россия
Татьяна В. Трегубчак
Кольцово, Новосибирская область
А. П. Агафонов
Россия
Александр П. Агафонов
Кольцово, Новосибирская область
Список литературы
1. Anderson J.F., Magnarelli L.A. Biology of ticks // Infectious Disease Clinics of North America. 2008. V. 22. N 2. P. 195–215. https://doi.org/10.1016/j.idc.2007.12.006
2. Guglielmone A.A., Robbins R.G., Apanaskevich D.A., Petney T.N., Estrada‐Peña A., Horak I. G., Shao R., Barker S.C. The Argasidae, Ixodidae and Nuttalliellidae (Acari: Ixodida) of the world:a list of valid species names // Zootaxa. 2010. V. 28. P. 27–54.
3. Kazimirova M., Thangamani S., Bartikova P., Hermance M., Holikova V., Stibraniova I., Nuttall P.A. Tick‐borne viruses and biological processes at the tick‐host‐virus interface // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2017. V. 7. P. 339. https://doi.org/10.3389/fcimb.2017.00339
4. Hermance M.E., Thangamani S. Powassan virus: An emerging arbovirus of public health concern in North America // Vector‐Borne and Zoonotic Diseases. 2017. V. 17. N 7. P. 453–462. https://doi.org/10.1089/vbz.2017.2110
5. Gould E.A., Solomon T. Pathogenic flaviviruses // Lancet. 2008. V. 371. P. 500–509. https://doi.org/10.1016/S0140‐6736(08)60238‐X
6. Hawman D.W., Feldmann H. Crimean‐Congo haemorrhagic fever virus // Nature reviews. Microbiology. 2023. V. 21. N 7. P. 463–477. https://doi.org/10.1038/s41579‐023‐00871‐9
7. Harris E.K., Foy B.D., Ebel G.D. Colorado tick fever virus: a review of historical literature and research emphasis for a modern era // Journal of medical entomology. 2023. V. 60. N 6. P. 1214–1220. https://doi.org/10.1093/jme/tjad094
8. McMullan L.K., Folk S.M., Kelly A.J., MacNeil A., Goldsmith C.S., Metcalfe M.G., Batten B.C., Albarino C.G., Zaki S.R., Rollin P.E., et al. A new phlebovirus associated with severe febrile illness in Missouri // The New England Journal of Medicine. 2012. V.367. N 9. P. 834–841. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1203378
9. Zhang Y.Z., Zhou D.J., Xiong Y., Chen X.P., He Y.W., Sun Q., Yu B., Li J., Dai Y.A., Tian J.H., et al. Hemorrhagic fever caused by a novel tickborne bunyavirus in huaiyangshan, China // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2011. V. 32. N 3. P. 209–220.
10. Zhang Y.Z., He Y.W., Dai Y.A., Xiong Y., Zheng H., Zhou D.J., Li J., Sun Q., Luo X.L., Cheng Y.L., et al. Hemorrhagic fever caused by a novel bunyavirus in China: Pathogenesis and correlates of fatal outcome // Clinical Infectious Diseases. 2012. V. 54. P. 527–533. https://doi.org/10.1093/cid/cir804
11. Yadav P.D., Whitmer S.L.M., Sarkale P., et al. Characterization of Novel Reoviruses Wad Medani Virus (Orbivirus) and Kundal Virus (Coltivirus) Collected from Hyalomma anatolicum Ticks in India during Surveillance for Crimean Congo Hemorrhagic Fever // Journal of Virology. 2019. V. 93. N 13. Article id: e00106‐19. https://doi.org/10.1128/JVI.00106‐19
12. Shi J., Hu Z., Deng F., Shen S. Tick‐Borne Viruses // Virologica Sinica. 2018. V. 33. N 1. P. 21–43. https://doi.org/10.1007/s12250018‐0019‐0
13. Zhang Y., Hu B., Agwanda B., Fang Y., Wang J., Kuria S., Yang J., Masika M., Tang S., Lichoti J., Fan Z., Shi Z., Ommeh S., Wang H., Deng F., Shen S. Viromes and surveys of RNA viruses in camelderived ticks revealing transmission patterns of novel tick‐borne viral pathogens in Kenya // Emerging Microbes & Infections. 2021. V. 10. N 1. P. 1975–1987. https://doi.org/10.1080/22221751.2021.1986428
14. Карташов М.Ю., Микрюкова Т.П., Кривошеина Е.И., Кузнецов А.И., Глушкова Л.И., Корабельников И.В., Егорова Ю.И., Терновой В.А., Локтев В.Б. Генотипирование возбудителей клещевого энцефалита и лихорадки Кемерово в таежных клещах, собранных в республике Коми // Инфекция и иммунитет. 2020. Т. 10. N 1. C. 159–166. http://dx.doi.org/10.15789/2220‐7619‐GOT‐1147
15. Law J., Jovel J., Patterson J., Ford G., O’Keefe S., Wang W., Meng B., Song D., Zhang Y., Tian Z., Wasilenko S.T., Rahbari M., Mitchell T., Jordan T., Carpenter E., Mason AL., Wong GK. Identification of hepatotropic viruses from plasma using deep sequencing: a next generation diagnostic tool // PLoS One. 2013. V. 8. N 4. Article id: e60595. https://doi.org/10/1371/journal.pone.0060595
16. Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M. The UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit // Bioinformatics. 2012. V. 28. N 8. P. 1166–1167. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts091
17. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for Bigger Datasets // Molecular Biology and Evolution. 2015. V. 33. N 7. P. 1870–1874. https://doi.org/10.1093/molbev/msw054
18. Saitou N., Nei M. The neighbor‐joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Molecular Biology and Evolution. 1987. V. 4. N 4. P. 406–425. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454
19. Confidence interval calculator. URL: http://www.pedro.org.au/english/downloads/confidence‐intervalcalculator (дата обращения: 18.04.2025)
20. Kodama F., Yamaguchi H., Park E., Tatemoto K. A novel nairovirus associated with acute febrile illness in Hokkaido, Japan // Nature Communications. 2021. V.12. N 1. P. 5539–5547. https://doi.org/10.1038/s41467‐021‐25857‐0
21. Nishino A., Tatemoto K., Ishijima K., Inoue Y., Park E.‐S., Yamamoto T., Taira M., Kuroda Y., Virhuez‐Mendoza M., Harada M., Nakamura N., Morimoto G., Yamaguchi H., Ariizumi T., Takano A., Shimoda H., Matsuno K., Maeda K. Transboundary Movement of Yezo Virus via Ticks on Migratory Birds, Japan, 2020‐2021 // Emerging Infectious Diseases. 2024. V. 30. N 12. P. 2674–2678. https://doi.org/10.3201/eid3012.240539
22. Zhang M.‐Z., Bian C., Ye R.‐Z., Cui X.‐M., Yao N.‐N., Yang J.‐H., Chu Y.‐L., Su X.‐L., Wu Y.‐F., Ye J.‐L., Liu S.‐S., Shi X.‐Y., Shi W., Jia N., Chen Y.‐G., Zhao L., Zheng Y.‐C., Zheng X.‐M., Jiang J.‐F., Cao W.‐C. A series of patients infected with the emerging tick‐borne Yezo virus in China: an active surveillance and genomic analysis // The Lancet Infectious Diseases. 2025. V. 25. N 4. P. 390–398. https://doi.org/10.1016/S1473‐3099(24)00616‐9
23. Wang R., Wang X., Zhu J., Li H., Liu W. Effectiveness of nucleoside analogs against Wetland virus infection // Antiviral Research. 2025. V. 236. Article id: 106114. https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2025.106114
24. Schwarz L., Riedel C., Högler S., Sinn L.J., Voglmayr T., Wöchtl B., Dinhopl N., Rebel‐Bauder B., Weissenböck H., Ladinig, A., et al. Congenital infection with atypical porcine pestivirus (APPV) is associated with disease and viral persistence // Veterinary Research. 2017. V. 48. P. 1–14. https://doi.org/10.1186/s13567‐016‐0406‐1
25. Manjunatha N.B., Sushila M., Narender S.M., Joe B., Robert T., Houssam A., Peter P.C.M. Genetic Characterization of the Tick‐Borne Orbiviruses // Viruses. 2015. V. 7. N 5. P. 2185–2209. https://doi.org/10.3390/v7052185
26. Tokarz R., Williams S.H., Sameroff S., et al. Virome analysis of amblyomma americanum, dermacentor variabilis, and Ixodes scapularis ticks reveals novel highly divergent vertebrate and invertebrate viruses // Journal of Virology. 2014. V. 88. N 19. P. 11480–11492. https://doi.org/10.1128/JVI.01858‐14
27. Belhouchet M., Mohd Jaafar F., Firth A.E., Grimes J.M., Mertens P.P., Attoui H. Detection of a fourth orbivirus non‐structural protein // PLOS ONE. 2011. V.6. Article id: e25697. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0025697
28. Ratinier M., Caporale M., Golder M., Franzoni G., Allan K., Nunes S.F., Armezzani A., Bayoumy A., Rixon F., Shaw A., et al. Identification and characterization of a novel non‐structural protein of bluetongue virus // PLOS Pathog. 2011. V. 7. Article id: e1002477. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002477
29. Mertens P.P., Brown F., Sangar D.V. Assignment of the genome segments of bluetongue virus type 1 to the proteins which they encode // Virology. 1984. V. 135. P. 207–217. https://doi.org/10.1016/0042‐6822(84)90131‐4
30. OIE. Terrestrial Animal Health Code. URL: https://www.oie.int/en/what‐we‐do/standards/codes‐andmanuals/terrestrial‐code‐online‐access/ (дата обращения: 18.04.2025)
31. Kirkland P.D., Frost M.J., Finlaison D.S., King K.R., Ridpath J.F., Gu X. Identification of a novel virus in pigs‐bungowannah virus: A possible new species of pestivirus // Virus Research. 2007. V. 129. P. 26–34. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2007.05.002
32. Michelitsch A., Dalmann A., Wernike K., Reimann I., Beer M. Seroprevalences of newly discovered porcine pestiviruses in german pig farms // Veterinary Sciences. 2019. V. 6. P. 86. https://doi.org/10.3390/vetsci6040086
33. Mósena A.C.S., Weber M.N., Cibulski S.P., Silva M.S., Paim W.P., Silva G.S., Medeiros A.A., Viana N.A., Baumbach L.F., Puhl D.E., et al. Survey for pestiviruses in backyard pigs in southern Brazil // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. 2020. V. 32. P. 136–141. https://doi.org/10.1177/1040638719896303
34. Yuan J., Han Z.; Li J., Huang Y., Yang J., Ding H., Zhang J., Zhu M., Zhang Y., Liao J., et al. Atypical porcine pestivirus as a novel type of pestivirus in pigs in China // Frontiers in Microbiology. 2017. V. 8. Article id: 862. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00862
35. Beer M., Wernike K., Dräger C., Höper D., Pohlmann A., Bergermann C., Schröder C., Klinkhammer S., Blome S., Hoffmann B. High prevalence of highly variable atypical porcine pestiviruses found in Germany // Transboundary and Emerging Diseases. 2017. V. 64. P. e22–e26. https://doi.org/10.1111/tbed.12532
36. Kartashov M.Y., Gladysheva A.V., Shvalov A.N., Tupota N. L., Chernikova A. A., Ternovoi V. A., Loktev V. B. Novel Flavi‐like virus in ixodid ticks and patients in Russia // Ticks and Tick‐borne Diseases. 2023. V. 14. Article id: 102101. https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2022.102101
37. Current ICTV Taxonomy Release. URL: https://ictv.global/taxonomy (дата обращения: 18.04.2025)
Рецензия
Для цитирования:
Терновой В.А., Пономарева Е.П., Тупота Н.Л., Степанюк М.А., Карташов М.Ю., Баяндин Р.Б., Трегубчак Т.В., Агафонов А.П. Вирусные трансмиссивные патогены в клещах из природных биотопов Европейской части России. Юг России: экология, развитие. 2025;20(4):24‐34. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2025-3-2
For citation:
Ternovoi V.A., Ponomareva E.P., Tupota N.L., Stepanyuk M.A., Kartashov M.Yu., Bayandin R.B., Tregubchak T.V., Agafonov A.P. Viral vector‐borne pathogens in ticks from natural habitats in the European part of Russia. South of Russia: ecology, development. 2025;20(4):24‐34. (In Russ.) https://doi.org/10.18470/1992-1098-2025-3-2
JATS XML





































