Генетическое разнообразие кандидатных маркеров у овец локальной породы Дагестана в контексте адаптации к горным пастбищным экосистемам

Целью исследования было изучение полиморфизма генов гормона роста (GH), калпастатина (CAST), фактора роста и дифференциации 9 (GDF9) и кератиноассоциированного белка (KAP1.3) у овец локальной аборигенной породы Дагестана методом полимеразной цепной реакции с рестрикционным анализом фрагментов (PCR‐RFLP). Материалом исследования послужили образцы крови 59 животных, отобранные с соблюдением этических норм. Лабораторные исследования проводили в аккредитованной лаборатории, где ДНК выделяли методом фенол‐хлороформной экстракции с последующей очисткой и спектрофотометрической оценкой качества. Генотипи‐ рование выполняли с использованием специфических праймеров и эндонуклеаз рестрикции с последующим электрофоретическим разделением продуктов реакции. Установлено преобладание гомозиготных генотипов по генам GH, CAST и GDF9, сопровождающееся высокой гомозиготностью и низкой полиморфной информативностью (PIC) по этим локусам. Напротив, локус KAP1.3 характеризовался повышенным уровнем генетического разнообразия и умеренной полиморфностью (PIC=0,375). Полученные данные позволяют сфокусировать подходы к использованию изученных генетических маркеров в селекционной работе без снижения генетического разнообразия поголовья.

1. Hassanane M.S., Salem M.H., Abdel-Rahman S.Z. et al. Genetic diversity and structure of Egyptian sheep populations using microsatellite markers // Small Ruminant Research. 2015. V. 123. N 1. P. 102–109. https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2014.11.009

2. Kijas J.W., Lenstra J.A., Hayes B. et al. Genome-wide analysis of the world's sheep breeds reveals high levels of historic mixture and strong recent selection // PLoS Biology. 2012. V. 10. N 2. Article ID e1001258. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.1001258

3. Celik S., Avanus K., Yilmaz O. Association of polymorphisms in the GH gene with growth traits in sheep // Indian Journal of Animal Research. 2017. V. 51. N 2. P. 337–341.

4. Скорых Л.Н., Фомина И.О., Суржикова Е.С. и др. Полиморфизм генов гормона роста (GH) и кальпастатина (CAST) у мясошерстных овец // Главный зоотехник. 2020. N 7. С. 6–11. https://doi.org/10.33920/sel-03-2007-01

5. Синица В.А., Гришина А.В., Курбатова А.С. Генетическая характеристика тонкорунных пород овец по гену CAST // Вестник Алтайского государственного аграрного университета. 2018. N 11. С. 34–38.

6. Moghadaszadeh A., Mirhoseini S.Z., Mohammadabadi M. et al. Polymorphism of GDF9 and BMP15 genes and their association with litter size in sheep // Iranian Journal of Biotechnology. 2021. V. 19. N 4. Article ID: e2800. https://doi.org/10.30498/IJB.2021.2800

7. Gootwine E. Breed and strain differences in the efficiency of growth in sheep // Small Ruminant Research. 2020. V. 185. Article ID: 106088. https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2020.106088

8. Vega-Pla J.L., Sanz A., Jugo B.M. et al. Genetic relationships and admixture between sheep breeds from southern Spain and northern Morocco revealed by microsatellite markers // Small Ruminant Research. 2022. V. 215. Article ID: 106736. https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2022.106736

9. Sutarno S., Setiadi M.A., Sumantri C. et al. Polymorphism of calpastatin gene and its association with growth traits in local Indonesian sheep // Asian-Australasian Journal of Animal Sciences. 2016. V. 29. N 9. P. 1290–1296. https://doi.org/10.5713/ajas.15.0965

10. Оздемиров А.А., Чижова Л.Н., Хожоков А.А., Суржикова Е.С., Догеев Г.Д., Абдулмагомедов С.Ш. Полиморфизм генов CAST, GH, GDF9 овец дагестанской горной породы // Юг России: экология, развитие. 2021. Т. 16. N 2. C. 39–44. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-2-39-44

11. Notter D.R. Genetic aspects of reproduction in sheep // Reproduction in Domestic Animals. 2008. V. 43. N 2. P. 122–128. https://doi.org/10.1111/j.1439-0531.2008.01147.x

12. Rashidi A., Mokhtari M.S., Esmailizadeh A.K. Genetic parameter estimates for growth traits in Kermani sheep // Small Ruminant Research. 2008. V. 74. N 2–3. P. 165–171. https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2007.03.012

13. Гаджиев З.К., Суржикова Е.С., Михайленко Т.Н., Евлагина Д.Д., Онищенко О.Н. Распределение частоты встречаемости аллелей гена кальпастатина у овец разных пород // Ветеринария и Зоотехния. 2023. N 5. С. 72–78. https://doi.org/10.28983/asj.y2023i5pp72-78

14. Miraei-Ashtiani S.R., Kohram H., Shahrbabak M.M. Polymorphism in exon 5 of the ovine GDF9 gene and its association with reproductive traits // South African Journal of Animal Science. 2019. V. 49. N 1. P. 1–6. https://doi.org/10.4314/sajas.v49i1.1

15. Kharzinova V.R., Dotsev A.V., Sermyagin A.A. et al. Genetic diversity and population structure of Russian sheep breeds based on microsatellite analysis // Russian Journal of Genetics. 2021. V. 57. N 2. P. 231–242. https://doi.org/10.1134/S1022795421020076