Парамиксовирус птиц APMV‐4, выделенный от кряквы обыкновенной (Anas platyrhynchos, Linnaeus, 1758): первый случай обнаружения в Западном Прикаспии
А. А. Дёрко,
Н. А. Дубовицкий,
Т. А. Мурашкина,
И. А. Соболев,
М. В. Соломатина,
А. Ю. Алексеев,
М. Г. Магомедов,
J. Mine,
Yu. Uchida,
T. Saito,
М. М. Каллаева,
К. А. Шаршов https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-3-81-87
Аннотация
Цель. Исследовать молекулярно‐генетические свойства парамиксовируса птиц 4 (APMV‐4), выделенного от кряквы обыкновенной (Anas platyrhynchos).
Материалы и методы. В 2018 году в рамках мониторинга вирусов гриппа А был проведён сбор биологического материала от диких птиц на озере Аджи (Папас) в Республике Дагестан. Культивирование вирусов из биологического материала осуществляли в системе развивающихся куриных эмбрионов. Первичное определение гемагглютинирующих агентов в жидкости аллантоисной полости проводили в реакции гемагглютинации. Наличие РНК вируса гриппа А определяли при помощи ПЦР. Для гемагглютинирующих агентов в пробах, в которых не были обнаружены вирусы гриппа А устанавливали полногеномную последовательность ДНК методом массового параллельного секвенирования. Принадлежность полученного штамма APMV‐4 к внутривидовым генетическим линиям определяли с помощью филогенетического анализа.
Результаты. Впервые на территории Западного Прикаспия был выявлен вирус APMV‐4. Филогенетический анализ полного генома и гена F показал принадлежность штамма APMV4/mallard/Dagestan/92d/2018 к Евразийскому субгенотипу гепотипа I. Анализ аминокислотных замен показал, что сайт расщепления белка слияния является моноосновным и характерен для лентогенных штаммов.
Заключение. В ходе программы мониторинга вирусов гриппа А осенью 2018 года был выделен APMV‐4 от кряквы обыкновенной. Наиболее филогенетически близкими оказались штаммы, полученные от двух диких и одной домашней утки из Китая, что может предполагать наличие связи между популяциями птиц Китая и Западного Прикаспия в рамках Западно‐Азиатского‐Восточно‐Африканского пути миграций.
При поддержке: Работа поддержана грантами РНФ 20‐44‐07001 «Распространение РНК‐вирусов птиц в Северной Азии и Азиатско‐Тихоокеанском регионе: генетическое разнообразие, патогенный потенциал и прогнозирование влияния на птицеводство» (лабораторная диагностика, вирусологические эксперименты, сбор материала, анализ) и РФФИ 21‐54‐53031 «Сравнительный анализ разнообразия микробиома и вирома кишечника у водоплавающих птиц Центрально‐Азиатского региона (плато Цинхай и юг Западной Сибири)» (анализ). Также данное исследование частично поддержано проектом JPJ008837 "Commissioned projects for promotion of strategic international collaborative research", финансируемым Министерством сельского, лесного и рыбного хозяйства Японии.
Об авторах
А. А. Дёрко
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Анастасия А. Дёрко, младший научный сотрудник
630117, г. Новосибирск, ул. Тимакова, 2
Тел. +79232547996
Н. А. Дубовицкий
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Никита А. Дубовицкий
Новосибирск
Т. А. Мурашкина
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Татьяна А. Мурашкина
Новосибирск
И. А. Соболев
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Иван А. Соболев
Новосибирск
М. В. Соломатина
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Мария В. Соломатина
Новосибирск
А. Ю. Алексеев
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Александр Ю. Алексеев
Новосибирск
М. Г. Магомедов
Дагестанский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Магомед Г. Магомедов
Махачкала
J. Mine
Национальный институт здоровья животных
Япония
Япония
Junki Mine
Цукуба
Yu. Uchida
Национальный институт здоровья животных
Япония
Япония
Yuko Uchida
Цукуба
T. Saito
Национальный институт здоровья животных
Япония
Япония
Takehiko Saito
Цукуба
М. М. Каллаева
Дагестанский государственный медицинский университет
Россия
Россия
Мариам М. Каллаева
Махачкала
К. А. Шаршов
Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины
Россия
Россия
Кирилл А. Шаршов
Новосибирск
Список литературы
1. Kariithi H.M., Ferreira H.L., Welch C.N., Ateya L.O., Apopo A.A., Zoller R., Volkening J.D., Williams‐Coplin D., Parris D.J., Olivier T.L., Goldenberg D., Binepal Y.S., Hernandez S.M., Afonso C.L., Suarez D.L. Surveillance and Genetic Characterization of Virulent Newcastle Disease Virus Subgenotype V.3 in Indigenous Chickens from Backyard Poultry Farms and Live Bird Marketsin Kenya // Viruses. 2021. V. 13. Iss. 1. P. 103. DOI: 10.3390/v13010103
2. Newcastle disease: OIE ‐ World Organisation for Animal Health. URL: https://www.oie.int/en/animal-health-in-theworld/animal-diseases/newcastle-disease/ (дата обращения: 17.01.2021)
3. Shortridge K.F., Alexander D.J. Incidence and preliminary characterisation of a hitherto unreported, serologically distinct, avian paramyxovirus isolated in Hong Kong // Res Vet Sci. 1978. N 1 (25). P. 128‐130.
4. Warke A., Stallknecht D., Williams S.M., Pritchard N., Mundt E. Comparative study on the pathogenicity and immunogenicity of wild bird isolates of avian paramyxovirus 2, 4, and 6 in chickens // Avian Pathology. 2008. V. 37. Iss. 4. P. 429‐434. DOI: 10.1080/03079450802216645
5. Zhang Q., Liu J., Han S., Wang B., Su Q., Yuan G., He H. Genetic and evolutionary characterization of avian paramyxovirus type 4 in China // Infection, Genetics and Evolution. 2021. V. 91. P. 104777. DOI: 10.1016/j.meegid.2021.104777
6. Tseren‐Ochir E.O., Yuk S.S., Khishgee B., Kwon J.H., Noh J.Y., Hong W.T., Jeong J.H., Gwon G.B., Jeong S., Kim Y.J., Kim J.B., Lee J.H., Kim K.J., Damdinjav B., Song C.S. Molecular characterization of avian paramyxovirus types 4 and 8 isolated from wild migratory waterfowl in Mongolia // Journal of Wildlife Diseases. 2018. V. 54. Iss. 2. P. 342‐346. DOI: 10.7589/2017‐03‐067
7. Yin R., Zhang P., Liu X., Chen Y., Tao Z., Ai L., Li J., Yang Y., Li M., Xue C., Qian J., Wang X., Chen J., Li Y., Xiong Y., Zhang J., Stoeger T., Bi Y., Chen J., Ding Z. Dispersal and transmission of avian paramyxovirus serotype 4 among wild birds and domestic poultry // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2017. V. 7. P. 212. DOI: 10.3389/fcimb.2017.00212
8. Abolnik C., Castro M. de, Rees J. Full genomic sequence of an African Avian Paramyxovirus Type 4 strain isolated from a wild duck // Virus Genes. 2012. V. 45. Iss. 3. P. 537‐541. DOI: 10.1007/s11262‐012‐0805‐y
9. Tseren‐Ochir E.O., Kwon J.H., Noh J.Y., Jeong J.H., Jeong S., Kim K.J., Lee J.H., Kim J.B., Kim Y.J., Lee S.H., Kim J.Y., Song C.S. Molecular characterization and genetic diversity of avian paramyxovirus type 4 isolated in South Korea from 2013 to 2017 // Infection, Genetics and Evolution. 2018. V. 61. P. 127‐133. DOI: 10.1016/j.meegid.2018.03.025
10. Shortridge K.F., Alexander D.J., Collins M.S. Isolation and Properties of Viruses from Poultry in Hong Kong which Represent a New (Sixth) Distinct Group of Avian Paramyxoviruses // The Journal of general virology. 1980. V. 49. Iss. 2. P. 255‐262. DOI: 10.1099/0022‐1317‐49‐22551980
11. McGinnes L.W., Pantua H., Reitter J., Morrison T.G. Newcastle disease virus: propagation, quantification, and storage // Curr Protoc Microbiol. 2006. V. 1. Iss. 1. P. 15F.2.1‐15F.2.18. DOI: 10.1002/9780471729259.mc15f02s01
12. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms // Molecular Biology and Evolution. 2018. V. 35. Iss. 6. P. 1547‐1549. DOI: 10.1093/molbev/msy096
13. Home – Nucleotide – NCBI. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide/ (дата обращения: 17.01.2021)
14. Алексеев A.Ю., Мурашкина Т.А., Джамалутдинов Д.М., Абдуллаев С.С., Ахмедрабаданов Х.А., Шаршов К.А. Анализ миграций птиц водного и околоводного комплекса на территории Республики Дагестан и обоснование выбора ключевых точек мониторинга гриппа А // Юг России: экология, развитие. 2019. T. 14. N 1. C. 137‐149. DOI: 10.18470/1992‐1098‐2019‐1‐137‐149
15. Liu H., Servan de Almeida R., Gil P., Albina E. Cleavage site of Newcastle disease virus determines viral fitness in persistent infection cells // Veterinary Microbiology. 2018. V. 216. C. 123‐131. DOI: 10.1016/j.vetmic.2018.02.006
Рецензия
Для цитирования:
Дёрко А.А., Дубовицкий Н.А., Мурашкина Т.А., Соболев И.А., Соломатина М.В., Алексеев А.Ю., Магомедов М.Г., Mine J., Uchida Yu., Saito T., Каллаева М.М., Шаршов К.А. Парамиксовирус птиц APMV‐4, выделенный от кряквы обыкновенной (Anas platyrhynchos, Linnaeus, 1758): первый случай обнаружения в Западном Прикаспии. Юг России: экология, развитие. 2021;16(3):81‐87. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-3-81-87
For citation:
Derko A.A., Dubovitskiy N.A., Murashkina T.A., Sobolev I.A., Solomatina M.V., Alekseev A.Yu., Magomedov M.G., Mine J., Uchida Yu., Saito T., Kallaeva M.M., Sharshov K.A. Avian paramyxovirus 4 isolated from the mallard (Anas platyrhynchos, Linnaeus, 1758): the first case detected in the Western Caspian region. South of Russia: ecology, development. 2021;16(3):81‐87. (In Russ.) https://doi.org/10.18470/1992-1098-2021-3-81-87
Просмотров:
732
Послать статью по эл. почте 
