ecodagЮг России: экология, развитиеSouth of Russia: ecology, development1992-10982413-0958State Institute of Applied Ecology of the Republic of Dagestan10.18470/1992-1098-2025-2-3ecodag-3437Research ArticleВИРУСОЛОГИЯVIROLOGYГенетическое разнообразие вируса лейкоза крупного рогатого скота и его распространение в районах Республики ДагестанГенетическое разнообразие вируса лейкоза крупного рогатого скота и его распространение в районах Республики Дагестанhttps://orcid.org/0009-0003-9052-6427БабошкоД. А.BaboshkoD. A.

Дмитрий А. Бабошко, аспирант НГУ, сотрудник отдела Ретровирусов

630559 Новосибирская область, г. Новосибирск, р/п Кольцово. Тел. +79831283892

 

Dmitry A. Baboshko, postgraduate student at Novosibirsk State University and employee Department of Retroviruses, Vector State Research Center of Virology and Biotechnology

Koltsovo, Novosibirsk, Novosibirskiy region, Russia 630559.Tel. +79831283892

baboshko_da@vector.nsc.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0456-3698ДаудоваМ. Г.DaudovaM. G.

Мадина Г. Даудова

Махачкала

Madina G. Daudova

Makhachkala

https://orcid.org/0009-0006-3120-6548АчигечеваП. Ю.AchigechevaP. Y.

Полина Ю. Ачигечева

Кольцово, Новосибирская область

Polina Y. Achigecheva

Koltsovo, Novosibirsk Region

https://orcid.org/0009-0002-6635-2642ЕлфимовК. А.ElfimovK. A.

Кирилл А. Елфимов

Кольцово, Новосибирская область

Kirill A. Elfimov

Koltsovo, Novosibirsk Region

https://orcid.org/0009-0007-7652-8628ДандамаевД. К.DandamaevD. K.

Даниял К. Дандамаев

Махачкала

Daniyal K. Dandamaev

Makhachkala

https://orcid.org/0009-0007-6496-8175ШахбановаЗ. Р.ShakhbanovaZ. R.

Заира Р. Шахбанова

Махачкала

 

Zaira R. Shakhbanova

Makhachkala

https://orcid.org/0000-0002-7418-4872ТотменинА. В.TotmeninA. V.

Алексей В. Тотменин

Кольцово, Новосибирская область

Alexey V. Totmenin

Koltsovo, Novosibirsk Region

https://orcid.org/0000-0002-0891-0880ГашниковаН. М.GashnikovaN. M.

Наталья М. Гашникова

Кольцово, Новосибирская область

Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» РоспотребнадзораVector State Research Center of Virology and BiotechnologyДагестанский государственный университетDagestan State University2025250720252023753Copyright © Бабошко Д.А., Даудова М.Г., Ачигечева П.Ю., Елфимов К.А., Дандамаев Д.К., Шахбанова З.Р., Тотменин А.В., Гашникова Н.М., 20252025Бабошко Д.А., Даудова М.Г., Ачигечева П.Ю., Елфимов К.А., Дандамаев Д.К., Шахбанова З.Р., Тотменин А.В., Гашникова Н.М.Baboshko D.A., Daudova M.G., Achigecheva P.Y., Elfimov K.A., Dandamaev D.K., Shakhbanova Z.R., Totmenin A.V., Gashnikova N.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://ecodag.elpub.ru/ugro/article/view/3437

Цель – исследовать распространение инфекции, вызванной вирусом лейкоза крупного рогатого скота, в хозяйствах Республики Дагестан.

Выполнена ПЦР-диагностика 212 проб крови КРС, собранных в хозяйствах Кизлярского, Кумторкалинского и Табасаранского районов, на наличие ДНК вируса лейкоза (ВЛКРС). Для ВЛКРС-положительных проб расшифрованы нуклеотидные последовательности фрагмента генома вируса, кодирующего основной белок оболочки (env), определен генотип вируса. Исследованы филогенетические отношения выделенных вариантов ВЛКРС с описанными ранее вирусами лейкоза коров.

Представленность генотипов вируса среди 80 ВЛКРС, выделенных в изученных районах, существенно отличалось. В Кизлярском и Кумторкалинском районе вирусы лейкоза G7 найдены в 7,4 %, в  92,6 % был выделен генотип G4. В одном хозяйстве Табасаранского района найдено 2 варианта G7 и один G4. При этом 10 из  11 вариантов G7 группировались друг с другом в три статистически достоверных кластера, включающих исследованные ВЛКРС, что указывает на передачу вируса внутри хозяйств и между ними. Филогенетический анализ 69 ВЛКРС генотипа G4 позволил заключить, что в Дагестане циркулирует гетерогенная популяция G4. Анализ случаев заражения лейкозом молодняка в неблагополучных хозяйствах и наличие филогенетических кластеров близких ВЛКРС подтверждают, что в настоящее время основной причиной регистрации новых случаев ВЛКРС является не занос ВЛРКС при закупках племенного скота, а передача инфекции внутри территорий Республики.

Молекулярно-генетический анализ ВЛКРС, выделенных в Дагестане, позволил описать связанные цепочки распространения вирусов как в одном хозяйстве, так и между хозяйствами. Результаты филогенетических исследований ВЛКРС имеют большую практическую значимость и могут быть использованы при планировании эффективных противоэпизоотических мероприятий в Дагестане. Кроме большой практической значимости выполненная работа демонстрирует новизну, так как вносит существенный вклад в изучение молекулярной эпидемиологии ВЛКРС в России.

To study the spread of infection caused by the bovine leukemia virus in farms of the Republic of Dagestan.

PCR diagnostics of 212 cattle blood samples collected in farms of the Kizlyarsky, Kumtorkalinsky and Tabasaransky districts was performed for the presence of bovine leukemia virus DNA (BLV). For BLV-positive samples, nucleotide sequences of the viral genome fragment encoding the main envelope protein (env) were deciphered, and the virus genotype was determined. Phylogenetic relationships of the isolated BLV varians with previously described bovine leukemia viruses were studied.

The representation of virus genotypes among 80 BLV isolated in the studied districts differed significantly. In the Kizlyarsky and Kumtorkalinsky districts, G7 leukemia viruses were found in 7.4 %, and the G4 genotype was isolated in 92.6 %. In one farm in the Tabasaran district, 2 G7 variants and one G4 variant were found. At the same time, 10 out of 11 G7 variants were grouped with each other into three statistically significant clusters, including the studied BLV, which indicates virus transmission within and between farms. Phylogenetic analysis of 69 BLV of the G4 genotype allowed us to conclude that a heterogeneous G4 population circulates in Dagestan. Analysis of cases of leukemia infection of young animals in unfavourable farms and the presence of phylogenetic clusters of close BLV confirm that at present the main reason for registering new BLV cases is not the introduction of BLV during the purchase of breeding cattle, but the transmission of infection within the territories of the Republic.

Molecular genetic analysis of BLV isolated in Dagestan allowed us to describe the related chains of virus spread both within one farm and between farms. The results of phylogenetic studies of BLV have great practical significance and can be used in planning effective anti-epizootic measures in Dagestan. In addition to great practical significance, the work performed demonstrates novelty, as it makes a significant contribution to the study of molecular epidemiology of BLV in Russia.

ВЛКРСгенотип G4генотип G7филогенетический анализПЦР-диагностикаBLVgenotype G4genotype G7phylogenetic analysisPCR diagnostics.Работа выполнена в рамках выполнения Государственного задания 4-21 ФБУН ГНЦ ВБ Вектор РоспотребнадзораThe work was carried out within the framework of the State Assignment of the State Scientific Center VB, Vector, of Rospotrebnadzor.ReferencesNAHMS-USDA Bovine Leukosis Virus on U.S. Dairy Operations. 2007.NAHMS‐USDA Bovine Leukosis Virus on U.S. Dairy Operations. 2007Донник И.М., Гулюкин М.И., Бусол В.А., Коваленко Л.В., Коваленко А.М. Лейкоз крупного рогатого скота — диагностика, оздоровление, антропозоонозный потенциал (история вопроса) (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2021. T. 56. N 2. C. 230–244. DOI: 10.15389/agrobiology.2021.2.230rusDonnik I.M., Gulyukin M.I., Busol V.A., Kovalenko L. V., Kovalenko A.M. Bovine leukemia virus INFECTION — diagnostics, eradication, and anthropozoonotic potential (background) (review). Agricultural Biology, 2021, vol. 56, no. 2, pp. 230–244. (In Russian) doi: 10.15389/agrobiology.2021.2.230rusГулюкин М.И., Иванова Л.А., Степанова Т.В., Барабанов И.И., Козырева Н.Г. Контроль и тенденции изменения эпизоотической ситуации по лейкозу крупного рогатого скота в 2000–2016 годах // Russian Journal of Agricultural and Socio-Economic Sciences. 2017. Т. 71. N 11. С. 530–537. https://doi.org/10.18551/rjoas.2017-11.70Gulyukin M.I., Ivanova L.A., Stepanova T.V., Barabanov I.I., Kozyreva N.G. Control and trends in the epizootic situation of bovine leukemia in 2000–2016. Russian Journal of Agricultural and Socio-Economic Sciences, 2017, vol. 71, no. 11, pp. 530–537. https://doi.org/10.18551/rjoas.2017-11.70Зубова Т.В., Плешков В.А., Миронов А.Н. Современные методы и опыт борьбы с лейкозом крупного рогатого скота // Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture. 2018. T. 10. N 5. C. 119–131. DOI: 10.12731/WSD-2018-5-119-131Zubova T.V., Pleshkov V.A., Mironov A.N. Modern methods and experience of struggle against leukemia of cattle. Siberian Journal of Life Sciences and Agriculture, 2018, vol. 10, no. 5, pp. 119–131. DOI: 10.12731/WSD-2018-5-119-131Чижова Л.Н., Белов Д.Е. Использование полимеразной цепной реакции в диагностике лейкоза КРС // Сборник научных трудов Ставропольского научно‐исследовательского института животноводства и кормопроизводства. 2004. Т. 2. N 2–2. С. 65–69.Chizhova L.N., Belov D.E. The use of polymerase chain reaction in the diagnosis of bovine leukemia. In: Sbornik nauchnykh trudov Stavropol’skogo nauchno‐issledovatel’skogo instituta zhivotnovodstva i kormoproizvodstva [Collection of scientific works of the Stavropol Research Institute of Livestock and Feed Production]. 2004, vol. 2, no. 2–2, pp. 65–69. (In Russian)Крюков В.И., Шалимова О.А., Друшляк Н.Г., Пикунова А.В. ДНК‐диагностика в селекции крупного рогатого скота // Вестник ОрелГАУ: Научное обеспечение животноводства. 2012. N 1. С. 62–68.Kryukov V.I., Shalimova O.A., Drushlyak N.G., Pikunova A.V. DNA diagnostics in cattle breeding. Vestnik OrelGAU: Nauchnoe obespechenie zhivotnovodstva [Bulletin of OrelSAU: Scientific support of livestock breeding]. 2012, no. 1, pp. 62– 68. (In Russian)Budulov N.R., Mikailov M.M., Gunashev S.A., Yanikova E.A., Khalikov A.A. Bovine leukemia virus occurrence in Dagestan // Veterinary Science Today. FGI Federal Centre for Animal Health (FGI ARRIA). 2023. V. 12. N 2. P. 111–118.Budulov N.R., Mikailov M.M., Gunashev S.A., Yanikova E.A., Khalikov A.A. Bovine leukemia virus occurrence in Dagestan. Veterinary Science Today. FGI Federal Centre for Animal Health (FGI ARRIA), 2023, vol. 12, no. 2, pp. 111–118.Sequencher Demo Software Informer: version 4.1 information. URL: https://sequencher.software.informer.com/4.1/ (дата обращения: 09.03.2025)Sequencher Demo Software Informer: version 4.1 information. URL: https://sequencher.software.informer.com/4.1/ (accessed 09.03.2025)GenBank Overview. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ (дата обращения: 16.04.2025)GenBank Overview. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ (accessed 16.04.2025)Minh B.Q., Schmidt H.A., Chernomor O., Schrempf D., Woodhams M.D., Von Haeseler A., Lanfear R., Teeling E. IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era // Mol Biol Evol. Mol Biol Evol. 2020. V. 37. N 5. P. 1530–1534. DOI: 10.1093/MOLBEV/MSAA015Minh B.Q., Schmidt H.A., Chernomor O., Schrempf D., Woodhams M.D., Von Haeseler A., Lanfear R., Teeling E. IQ-TREE 2: New Models and Efficient Methods for Phylogenetic Inference in the Genomic Era. Mol Biol Evol. Mol Biol Evol, 2020, vol. 37, no. 5, pp. 1530–1534. DOI: 10.1093/MOLBEV/MSAA015Бабошко Д.А., Елфимов К.А., Даудова М.Г., Койчуев Х.Г., Гапизова Х.Ф., Гашникова Н.М. Оценка пораженности крупного рогатого скота вирусом лейкоза в Республике Дагестан с помощью ПЦР‐диагностики // Юг России: экология, развитие. 2023. T. 18. N 4, C. 114–124. https://doi.org/10.18470/1992-1098-2023-4-114-124Baboshko D.A., Elfimov K.A., Daudova M.G., Koychuev Kh.G., Gapizova Kh.F., Gashnikova N.M. Assessment of the incidence of leukemia virus (BLV) in cattle in the Republic of Dagestan using PCR diagnostics. South of Russia: ecology, development, 2023, vol. 18, no. 4, pp. 114–124. (In Russian) https://doi.org/10.18470/1992-1098-2023-4-114-124Бабошко Д.А., Елфимов К.А., Кузьмин А.И., Рожков О.А., Тотменин А.В., Флеер М.В., Гашникова Н.М. Формирование свободного от энзоотического лейкоза крупного рогатого скота стада на основе ПЦР-диагностики телят // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. 2024. Т. 54. N 12. С. 68–79. DOI: 10.26898/0370-8799-2024-12-8Baboshko D.A. Elfimov K.A., Kuzmin A.I., Rozhkov O.A., Totmenin A.V., Fleer M.B., Gashnikova N.M. Formation of the herd free from enzootic bovine leukosis on the basis of pcr-diagnostics of calves. Siberian Bulletin of Agricultural Science, 2024, vol. 54, no. 12, pp. 68–79. DOI: 10.26898/0370-8799-2024-12-8

The authors declare that there are no conflicts of interest present.